สำนักข่าว NHK ของญี่ปุ่น รายงานเมื่อ 20 มิ.ย.64 ว่า ญี่ปุ่นตรวจพบนักกีฬาที่เข้าร่วมแข่งขันกีฬาโอลิมปิกติดเชื้อโควิด-19 รายแรก เป็นนักกีฬาจากยูกันดา และกักตัวนักกีฬาคนดังกล่าวไว้ในสถานกักกันโรคภายในสนามบินนาริตะ ของญี่ปุ่น จนท.ญี่ปุ่นระบุเพิ่มเติมว่า นักกีฬาและ จนท.ของยูกันดา 9 คน เดินทางถึงญี่ปุ่นเมื่อ 19 มิ.ย. 64 โดยทุกคนได้รับวัคซีนป้องกันเชื้อ COVID-19 ก่อนเดินทางออกนอกประเทศ อย่างไรก็ดี นักกีฬาและ จนท.ที่ไม่พบเชื้อ COVID-19 จะเดินทางไปเก็บตัวที่ค่ายพักนักกีฬา จังหวัดอิซูมิซาโนต่อไป อนึ่ง นักกีฬาและ จนท.ของยูกันดาเป็นนักกีฬากลุ่มที่ 2 ซึ่งเดินทางถึงญี่ปุ่นเพื่อเข้าร่วมแข่งขันกีฬาโอลิมปิกในครั้งนี้ หลังจากทีมซอฟท์บอลหญิงของออสเตรเลียเดินทางมาถึงเมื่อ 1 มิ.ย.64
