สำนักข่าว Kyodo รายงานเมื่อ 4 ส.ค.64 ว่า คณะผู้จัดการแข่งขันโตเกียวโอลิมปิก รายงานวันเดียวกันว่า พบคลัสเตอร์ของการติดเชื้อ COVID-19 ในหมู่บ้านนักกีฬาเป็นครั้งแรกนับตั้งแต่เริ่มการแข่งขัน โดยพบผู้ติดเชื้อ 5 ราย เมื่อ 3 ส.ค.64 เป็นนักกีฬาทีมระบำใต้น้ำของกรีซ 4 คน และเจ้าหน้าที่ 1 คน จากจำนวนสมาชิกทั้งหมดของทีม 12 คนส่งผลให้กรีซต้องถอนตัวออกจากการแข่งขันระบำใต้น้ำ ขณะที่นักกีฬาทีมระบำใต้น้ำกรีซได้ย้ายออกจากหมู่บ้านนักกีฬาไปอยู่ที่ศูนย์กักตัวผู้ติดเชื้อ COVID-19 แล้ว
อนึ่ง ใน 4 ส.ค.64 พบผู้ติดเชื้อ COVID-19 ที่เกี่ยวข้องกับการแข่งขันกีฬาโอลิมปิกเพิ่มขึ้น 29 ราย เป็นจำนวนสูงสุดตั้งแต่ 23 ก.ค.64 และมียอดสะสมผู้ติดเชื้อ 322 ราย ซึ่งจำนวนสะสมนี้จะไม่นำไปรวมกับจำนวนผู้ติดเชื้อในประเทศที่ประกาศโดยรัฐบาลกลางและรัฐบาลท้องถิ่น
