สำนักข่าว NHK รายงานเมื่อ 10 ก.ย.64 ว่ากระทรวงสาธารณสุข แรงงาน และสวัสดิการญี่ปุ่นยืนยันการตรวจพบผู้ติดเชื้อ COVID-19 สายพันธุ์ Eta ครั้งแรกในประเทศ โดยพบในผู้เดินทางเข้าญี่ปุ่นระหว่าง ธ.ค.63 – 3 ก.ย.64 จำนวน 18 ราย ทั้งนี้ เชื้อ COVID-19 สายพันธุ์ Eta ตรวจพบครั้งแรกที่สหราชอาณาจักรเมื่อ ธ.ค.63 และส่วนใหญ่แพร่ระบาดในสหรัฐฯ และภูมิภาคยุโรป นอกจากนี้ กระทรวงสาธารณสุขฯ ญี่ปุ่นยังเปิดเผยว่า ได้ตรวจพบผู้ติดเชื้อ COVID-19 สายพันธุ์ Kappa จำนวน 19 รายเมื่อ 3 ก.ย.64
ทั้งนี้ องค์การอนามัยโลก (World Health Organization-WHO) ประกาศจับตาไวรัสทั้งสองสายพันธุ์ดังกล่าว โดยระบุว่าเป็นสายพันธุ์ที่ต้องให้ความสนใจ (variants of interest)