สำนักข่าว Japan Today รายงานเมื่อ 5 ก.ย.66 ว่า ศาลฎีกาญี่ปุ่นอ่านคำพิพากษาเมื่อ 4 ก.ย.66 โดยพิพากษายืนตามคำพิพากษาของศาลอุทธรณ์เมื่อ มี.ค.66 ให้แผนก่อสร้างทางวิ่ง (Runway) สำหรับอากาศยานของนาวิกโยธิน(นย.)สหรัฐฯ ในญี่ปุ่น รวมถึงข้อสั่งการของรัฐบาลญี่ปุ่นให้จังหวัดโอกินาวามีคำสั่งอนุญาตก่อสร้างตามแผนดังกล่าวชอบด้วยกฎหมาย หลังรัฐบาลญี่ปุ่นยื่นคำขอแก้ไขแผนก่อสร้าง เนื่องจากสำรวจพบว่าบริเวณที่รัฐบาลญี่ปุ่นเริ่มเตรียมพื้นที่เพื่อการก่อสร้างตั้งแต่ปี 2561 มากถึงร้อยละ 70 มีลักษณะเป็นดินอ่อน แต่จังหวัดโอกินาวาไม่อนุญาตตามคำขอและมีคำสั่งระงับแผนก่อสร้าง
ทั้งนี้ นายทามากิ เดนนี ผู้ว่าราชการจังหวัดโอกินาวา ระบุว่า รู้สึกผิดหวังต่อคำพิพากษาของศาลฎีกา เนื่องจากขัดต่อหลักการความเป็นอิสระด้านการตัดสินใจขององค์กรปกครองส่วนท้องถิ่น อีกทั้งอาจขัดต่อสิทธิด้านการปกครองส่วนท้องถิ่นตามรัฐธรรมนูญ ซึ่งจังหวัดโอกินาวาจะยังไม่ปฏิบัติตามแผนของรัฐบาลญี่ปุ่นแม้ศาลฎีกาจะมีคำพิพากษาแล้ว โดยจะทบทวนคำพิพากษาอย่างละเอียดอีกครั้งก่อนพิจารณาดำเนินการต่อไป