กระทรวงการต่างประเทศญี่ปุ่น ออกแถลงการณ์เมื่อ 4 ก.ย.66 ว่า ญี่ปุ่นยื่นหนังสือโต้แย้งจีนต่อองค์การการค้าโลก (World Trade Organization-WTO) จากกรณีจีนมีหนังสือถึง WTO เมื่อ 31 ส.ค.66 เพื่อแจ้งการบังคับใช้มาตรการฉุกเฉินของจีนเพื่อระงับการนำเข้าผลิตภัณฑ์สัตว์น้ำจากญี่ปุ่นทั้งหมด จากเดิมที่ระงับการนำเข้าเพียงบางส่วน ซึ่งเป็นการแจ้งให้ WTO ทราบตามความตกลงว่าด้วยการบังคับใช้มาตรการสุขอนามัยและสุขอนามัยพืช (Agreement on the Application of Sanitary and Phytosanitary Measures-SPS Agreement) ของ WTO โดยญี่ปุ่นชี้แจงถึงความปลอดภัยของน้ำเสียที่ผ่านการบำบัดด้วยระบบบำบัดน้ำเสียขั้นสูง (Advanced Liquid Processing System-ALPS) จากโรงไฟฟ้านิวเคลียร์ฟูกูชิมะที่ 1 (Fukushima Daiichi Nuclear Power Station-FDNPS) และญี่ปุ่นยังคงเฝ้าติดตามผลหลังเริ่มปล่อย ALPS ลงทะเลเมื่อ 24 ส.ค.66 และจะชี้แจงท่าทีของญี่ปุ่นในประเด็นดังกล่าวต่อคณะกรรมการต่าง ๆ ของ WTO ที่เกี่ยวข้องอย่างต่อเนื่องต่อไป
