ฝ่ายต่อต้านรัฐบาลอิหร่านเผยแพร่ข่าวสารผ่าน Telegram เมื่อ 16 มิ.ย.68 ว่า อายะตุลลอฮ์ อะลี คอมะนะอี ผู้นำสูงสุดของอิหร่าน เสียชีวิตจากการโจมตีของอิสราเอล และจะมีแถลงการณ์ใน 48 ชม. (ภายใน 18 มิ.ย.68) สนข. Reuters รายงานเมื่อ 15 มิ.ย.68 อ้างการเปิดเผยของ จนท.สหรัฐฯ 2 รายว่า อิสราเอลเคยแจ้งให้สหรัฐฯ ทราบถึงความเป็นไปได้ที่อิสราเอลจะสังหารผู้นำสูงสุดของอิหร่าน แต่ประธานาธิบดีโดนัลด์ ทรัมป์ ของสหรัฐฯ ยับยั้ง อนึ่ง ผู้นำสูงสุดของอิหร่านปรากฏตัวในที่สาธารณะครั้งสุดท้ายเมื่อ 13 มิ.ย.68 ซึ่งเป็นการกล่าวปราศรัยผ่านสถานีโทรทัศน์เกี่ยวกับปฏิบัติการโจมตีอิหร่านภายใต้รหัส Operation Rising Lion ของอิสราเอล ขณะที่เว็บไซต์ Iran International รายงานเมื่อ 15 มิ.ย.68 โดยอ้างแหล่งข่าวที่ใกล้ชิดรัฐบาลอิหร่านว่า ผู้นำสูงสุดของอิหร่านและอครอบครัวได้ย้ายเข้าไปยังที่หลบภัยใต้ดินบริเวณย่าน Lavizan ทาง ตอ.น.ของกรุงเตหะรานตั้งแต่ 13 มิ.ย.68