รัฐมนตรีว่าการกระทรวงการต่างประเทศของกัมพูชากับญี่ปุ่นได้มีการพบหารือกันเป็นครั้งที่ 3 ในรอบปี 2568 ระหว่างนอกรอบการประชุมสมัชชาสหประชาชาติ (UNGA) ที่นครนิวยอร์ก สหรัฐฯ เมื่อ 25 กันยายน 2568 โดยเมื่อพฤษภาคม 2568 พบกันในโอกาสที่นายฮุน มาเน็ต นายกรัฐมนตรีกัมพูชาเยือนญี่ปุ่น และเมื่อกรกฎาคม 2568 พบกันที่การประชุมรัฐมนตรีต่างประเทศอาเซียนที่มาเลเซีย ซึ่งสะท้อนความใกล้ชิดและความร่วมมือที่ทั้งสองฝ่ายจะเพิ่มมากขึ้นในหลาย ๆ ด้าน สำหรับในการพบกันครั้งที่ 3 นี้ รัฐมนตรีว่าการกระทรวงการต่างประเทศญี่ปุ่นยังได้กล่าวถึงประเด็นความขัดแย้งระหว่างไทยกับกัมพูชาด้วย
ในการพบหารือระหว่าง นายปร๊ะ สุคน รองนายกรัฐมนตรี และรัฐมนตรีว่าการกระทรวงการต่างประเทศกัมพูชา กับนายทาเคชิ อิวายะ รัฐมนตรีว่าการกระทรวงการต่างประเทศญี่ปุ่นที่นครนิวยอร์ก ทั้งสองฝ่ายจะร่วมมือกันมากขึ้น ซึ่งจะทำให้กัมพูชาจะมีความก้าวหน้าด้านอุตสาหกรรม และดิจิทัล เช่น ญี่ปุ่นจะเข้าไปส่งเสริมการลงทุนภาคเอกชนและภาคอุตสาหกรรมในกัมพูชา ในโครงการ Economic Co-Creation Package การพัฒนาท่าเรือสีหนุวิลล์ และการพัฒนาเครือข่ายโทรคมนาคมหลัก รวมถึง 5G เป็นต้น
นายอิวายะได้แสดงความเสียใจต่อนายปร๊ะ สุคน กรณีเหยื่อชาวกัมพูชาเสียชีวิตจากการปะทะทางทหารกับไทย พร้อมหวังว่าทั้งสองฝ่ายจะปฏิบัติตามข้อตกลงหยุดยิง และใช้การเจรจา ญี่ปุ่นจะยังพยายามสนับสนุนลดระดับความรุนแรงของสถานการณ์ ทั้งนี้ ญี่ปุ่นให้ความช่วยเหลือกัมพูชาด้านมนุษยธรรม และการทูต เพื่อยุติความขัดแย้งกับไทย โดยให้ความช่วยเหลือจำนวน 1 ล้านดอลลาร์สหรัฐ ผ่านสถานเอกอัครราชทูตในกัมพูชา เพื่อช่วยเหลือผู้พลัดถิ่น และเมื่อกันยายน 2568 ให้อีก 1.8 ล้านผ่าน UNICEF และองค์การระหว่างประเทศเพื่อการโยกย้ายถิ่นฐาน (IOM)
กัมพูชาและญี่ปุ่นยังหารือร่วมกันที่จะเพิ่มความร่วมมือด้านการท่องเที่ยว โดยนาย Huot Hak รัฐมนตรีท่องเที่ยวกัมพูชาได้พบหารือกับนายกเทศมนตรีเมืองนาโกยา และตัวแทนของสมาคมบริษัทการท่องเที่ยว Association of Travel Agents (JATA) ของญี่ปุ่น เมื่อ 24 -25 กันยายน 2568 โดยจะส่งเสริมให้ชาวญี่ปุ่นเดินทางไปท่องเที่ยวในกัมพูชามากขึ้น ซึ่งจะช่วยให้ธุรกิจที่เกี่ยวข้องของกัมพูชากระเตื้องขึ้น เช่น โรงแรม และร้านอาหาร ในห้วงเดียวกัน รัฐมนตรีท่องเที่ยวกัมพูชาได้หารือกับบริษัทการท่องเที่ยวของญี่ปุ่นที่กัมพูชาอีกด้วย ซึ่งอาจจะมีการเพิ่มเที่ยวบินตรงระหว่างกัน ทั้งนี้ ในรอบ 8 เดือน (มกราคม-สิงหาคม) ของปี 2568 มีนักท่องเที่ยวญี่ปุ่นไปเที่ยวกัมพูชาแล้วประมาณ 73,000 คน
